Citogenética e genômica em Parodontidae

 

Na evolução biológica é proposto que a modificação de rotas de regulação gênica em genes do desenvolvimento tem grande impacto para a especiação. Este projeto aborda a linha de investigação em peixes neotropicais de diversificação cariotípica, estudos de genes do desenvolvimento gonadal, co-opção molecular de elementos transponíveis, determinação da região restrita ao cromossomo W e, estudos genômicos em Parodontidae. A família Parodontidae detém número diploide conservado de 54 cromossomos, com espécies sem sistemas de cromossomos sexuais heteromórficos, com proto-cromossomos sexuais e, outras com sistemas de cromossomos sexuais do tipo ZZ/ZW ou ZZ/ZW1W2. Aliado a estes fatores, grande parcela da diversificação cariotípica observada nas espécies desta família é devida a movimentação de DNAs repetitivos, proporcionando os rearranjos cariotípicos. Ainda, inúmeros estudos demonstraram que os elementos transponíveis podem ser co-optados (quando um elemento transponível degenerado passa a servir para alguma função no genoma). Nesta temática, esta linha de pesquisa possui sequenciamento de nova geração e a organização dos genomas macho, fêmea, ambos, e ‘cromossomo W’ de uma espécie de Parodontidae portadora de cromossomos sexuais ZW. Com estes genomas, serão realizadas análises de recuperação de sequências de DNA acumuladas em um determinado sexo e, análises comparativas de genes do desenvolvimento gonadal para avaliar a co-opção molecular de elementos transponíveis nas regiões reguladoras de genes. Para isto, serão utilizadas ferramentas de genômica, biologia molecular, sequenciamento de DNA, caracterização das sequências, citogenética convencional/molecular e bioinformática, com intuito de integrar os dados, permitindo a compreensão de mecanismos atuantes na diversificação cromossômica e genética em modelos de peixes Neotropicais.

Pesquisa Básica e Aplicada – UEPG e Fundação Araucária

Pesquisadores:

Prof. Dr. Marcelo Ricardo Vicari

Profa. Dra. Viviane Nogaroto

 

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